Il Consiglio direttivo dell'Ordine dei Medici Chirurghi e degli Odontoiatri di Siena é composto da quindici membri dato che gli iscritti all'Albo Medici Chirurghi risultano essere in numero superiore a millecinquecento, cui si aggiungono due rappresentanti dell'Albo Odontoiatri.  
I componenti del Consiglio durano in carica quattro anni e l'assemblea per la loro elezione deve essere convocata entro il mese di novembre dell'anno in cui il Consiglio scade.

Ogni Consiglio elegge nel proprio seno un presidente, un vicepresidente, un tesoriere ed un segretario. 

Il presidente ha la rappresentanza dell'Ordine e Collegio, di cui convoca e presiede il Consiglio direttivo e le assemblee degli iscritti; il vice-presidente lo sostituisce in caso di assenza o di impedimento e disimpegna le funzioni a lui eventualmente delegate dal presidente. 

Al Consiglio direttivo di ciascun Ordine e Collegio spettano le seguenti attribuzioni: 

1. compilare e tenere l'albo dell'Ordine e del Collegio e pubblicarlo al principio di ogni anno;
2. vigilare alla conservazione del decoro e della indipendenza dell'Ordine e del Collegio;
3. designare i rappresentanti dell'Ordine o Collegio presso commissioni, enti ed organizzazioni di carattere provinciale o comunale;
4. promuovere e favorire tutte le iniziative intese a facilitare il progresso culturale degli iscritti;
5. dare il proprio concorso alle autorità locali nello studio e nell'attuazione dei provvedimenti che comunque possono interessare l'Ordine od il Collegio;
6. esercitare il potere disciplinare nei confronti dei sanitari iscritti nell'albo;
7. interporsi, se richiesto, nelle controversie fra sanitario e sanitario, o fra sanitario e persona o enti a favore dei quali il sanitario abbia prestato o presti la propria opera professionale, per ragioni di spese, di onorari e per altre questioni inerenti all'esercizio professionale, procurando la conciliazione della vertenza e, in caso di non riuscito accordo, dando il suo parere sulle controversie stesse.

Il Consiglio provvede all'amministrazione dei beni spettanti all'Ordine e propone all'approvazione dell'assemblea il bilancio preventivo ed il conto consuntivo.

Consiglio Direttivo

Commissione Albo Medici

Commissione Albo Odontoiatri

Collegio dei Revisori dei conti

Commissione Giovani Medici

Commissione per le Medicine Complementari

Commissione per la Medicina di Genere/Pari Opportunità

Commissione Ambiente

Commissione Provinciale ENPAM per l'Invalidità

Commissione Ospedale Territorio

Personale amministrativo